Diplomski sveučilišni studij Pomorstvo traje dvije godine, ili četiri semestra (120 ECTS bodova).

Po završetku diplomskog studija student stječe akademski naziv magistar/magistrica inženjer/inženjerka pomorskog prometa.

Temeljni cilj sustavnom obrazovanju pomorskog kadra je stjecanje kompetencija i vještina za upravljanje, održavanje i rukovanje suvremenim tehničkim i tehnološkim brodskim, lučkim i prometnim sustavima, znanstvenoistraživački rad u područjima pomorskih znanosti, aktivno sudjelovanje u gospodarskim djelatnostima, učinkovito upravljanje poduzećima i službama u području gospodarskih i javnih djelatnosti, s konačnom svrhom intenzivnijeg razvitka pomorskoga gospodarstva u cjelini.

Nakon završetka diplomskog studija Pomorstvo studentima je omogućen upis na poslijediplomski znanstveni doktorski studij Pomorstvo, nositelj kojega je Pomorski fakultet u Rijeci u suradnji sa Sveučilištem u Dubrovniku, Sveučilištem u Zadru, pomorskim fakultetom u Splitu, Hrvatskim hidrografskim institutom i Hrvatskom ratnom mornaricom.

Nastava se odvija u manjim grupama, uz usavršavanje pomorskih znanja i vještina stalnim praktičnim uvježbavanjem. Poseban naglasak je stavljen na mentorski rad sa studentima. Time se stvaraju stručnjaci za potrebe kompleksnog pomorskoga gospodarstva.